发动机电控系统发生故障时，应按照先机械后电子、先一般后专项、先易后难的原则进行检测诊断。
(1)先外后内。由于机械故障一般比较直观，容易检测，而电子故障一般比较隐蔽，不容易检测，所以，在发动机出现故障时，先对电子控制系统以外的可能故障部位予以检查。这样可避免本来是一个与电子控制系统无关的故障，却对系统的传感器、ECU、执行器及线路等进行复杂且费力的检查，而真正的故障可能较容易查找却未能找到。 (2)先简后繁 先检查能用简单方法检查的可能故障部位。比如直观检查最为简单，可以用看（用眼睛观察线路是否有松脱、断裂等）、摸（用手摸一摸可疑线路连接处有无不正常的高温以判断该处是否接触不良等，、听f用耳桑或借助于旋具、听诊器等听一听开关、继电器等有无通断的声音、电动机运转的声音是否正常等）等直观检查方法将一些较为明显的故障迅速地找出来。
当直观检查未找出故障，需借助于仪器仪表或其他专用工具来进行检查时，也应对较容易查的项目先予以检查，能就车检查的项目先进行检查。 (3)先熟后生。由于结构和使用环境等原因，发动机的某一故障现象可能是以某些总成或部件的故障最为常见，应先对这些常见故障部位进行检查。
若未找出故障，再对其他不常见的可能故障部位予以检查。这样做往往可以收到事半功倍的效果，省时省力。 (4)故障码优先。电子控制系统一般都有故障自诊断功能。当 电子控制系统出现某种故障时，故障自诊断系统就会立刻监测到故障，并通过“检测发动机”等警告灯向驾驶人报警，与此同时以代码的方式储存该故障的信息。
因此，当 电控系统出现故障时，应先按制造厂提供的方法读取故障码，并检查和排除代码所指的故障部位。待故障码所指的故障消除后，如果发现机故障现象还未消除，或者开始就无故障码输出，再对发动机可能的故障部位进行检查。 (5)先思后行。对发动机的故障现象应先进行故障分析，在了解了可能的故障原因有哪些的基础上再进行故障检查。
这样可避免故障检查的盲目性，既不会对与故障现象无关的部位做无效的检查，又可避免对一些有关部位漏检而不能迅速排除故障。 (6)先备后用。电子控制系统中一些部件的性能好坏或电气线路正常与否，常以其电压或电阻等参数来判断。如果没有这些数据资料，系统的故障诊判将会很困难，往往只能采取用新件替换的方法，这些方法有时会造成维修费用猛增且费工费时。
所谓先备后用是指在检修某型车辆时，应准备好该车型的有关检修数据资料。除了从维修手册、专业书刊上收集整理这些检修数据资料外，另一个有效的途径是利用各种机会对无故障车辆的相关系统进行测量，并记录下来有关参数，作为日后检修同类型车辆的第一手资料。如果平时注意做好这项工作，会给系统的故障检查带来方便。