上汽大众斯柯达
大众旗下的新生力军
1989年后，随着捷克经济体制的改变，斯柯达又一次开始寻找强势的合作伙伴。1991年至2000年，经过多次股权变更，斯柯达成为大众的全资子公司。从此，斯柯达借助大众的技术优势和管理经验，使旗下各品牌重树高品质和个性化形象，质量和市场推广方面得到长足进步，甚至成为世界畅销车。大众改变了斯柯达汽车，挽救了斯柯达公司，也改变了人们对斯柯达的印象。
斯柯达明锐
斯柯达卖厂是捷克人生存本领的又一例证。在大众公司的全力支持下，斯柯达公司的规模得到迅猛发展。汽车销量均超过40万辆，在德国，订购欧雅有时要等待相当长时间才能拿到货。斯柯达产品销售到全球的70多个国家。工人的月工资也从以 前的3000克朗(约60美元)涨到了现 在的2万克朗(约400美元)。大众也同样受益菲浅，收购斯柯达公司后的回报十分可观。在后几年的收购过程中，大众完全不用追加新的投资，其对斯柯达的投资回报就足够了。
大众收购斯柯达后的第一款重要车型就是重新设计的弗雷希亚。此款车型的推出，大众动用了强有力的技术、公关和宣传队伍，目的就是要彻底改变斯柯达以往简陋的形象。
经过对车型的筛选和改进，如今斯柯达车系的生力军要数1996年的新欧雅(Octavia)、1999年推出的经济型法比亚(Fabia)和2001年的全新速派(Superb)。斯柯达汽车远离镉、石棉和氟利昂，最大限度地使用可再回收材料，有着良好的舒适性和环保特性。
法比亚在设计上充分注重舒适性，使驾车者在长途驾驶时也不会感到厌倦，确保质量好，操作方便，内饰精致，具有多功能性、实用性和经济性。法比亚有紧凑型轿车、三厢轿车、旅行轿车和运动多功能车几种型号，共有五种汽油机及两种柴油机供用户选择，其中汽油机以排量1.4升为主，并达到2005年生效的欧洲5号排放标准。
1996年投放市场的欧雅第一次采用了大众汽车A级车平台，因其价廉物美而深受年轻人的喜爱。欧雅在欧洲市场车型系列非常宽，从中尺寸轿车到旅行车和运动型多功能车一应俱全。
而今，最受推崇的斯柯达顶级车就是有着历史渊源的速派了。大众集团欲借速派光辉的历史重塑其豪华形象。速派于2002年正式引入中国，销量非常喜人。虽然外形与现 在的帕萨特有几分相似，但两车的定位是截然不同的，走高档车路线的速派也不断得到更多人认同。
现代汽车工业发展
斯柯达到已经达到年产汽车45万辆的生产销售规模，其中欧雅和法比亚的产量都已经超过100万台，其中捷克国内销售占20%左右，其余80%全部出口到德国、英国以及欧洲、美洲、以及包括中国在内的亚洲国家，其中德国是斯柯达最大的出口国。2003年，德国的斯柯达汽车销量达到7万多辆，其次为英国，斯柯达已经成为英国第二大进口车品牌，其他的出口国包括意大利、波兰、斯洛伐克等。
进入21世纪的斯柯达汽车已经从真正意义上迎来了自己的辉煌。斯柯达汽车通过对大众汽车文化的理解、技术的吸收、经验的吸取，如今已经成为大众汽车旗下比较活跃的一个品牌，是大众汽车汽车集团不断开拓市场的主打品牌。
2005年4月，ŠKODA AUTO与上海大众汽车有限公司开展合作，开启了斯柯达汽车中国之路。
2006年9月，ŠKODA品牌正式启动，宣布其中文名“斯柯达汽车”。
2007年6月6日，斯柯达在中国的首款战略车型Octavia明锐正式上市。
2008年12月22日，斯柯达品牌第二款车型Fabia晶锐正式进入中国。
2009年8月18日，斯柯达汽车全新B级车Superb速派正式上市。
2010年9月30日，斯柯达汽车公司全系列第二代环保型GreenLine绿动轿车亮相巴黎国际车展。
2011年，斯柯达汽车以全新企业形象开启新纪元，原有的飞翔之箭图标经过重新设计，颜色更加鲜明， 飞翔之箭的颜色由“自然绿”变更为全新的“斯柯达绿”。
2011年，斯柯达汽车全球销量达到875,000辆。
2012年1月10日，斯柯达发布了2011年详细销量数据。2012年，斯柯达汽车向市场推出了三款全新改进车型，包括新Octavia、新Citigo和Rapid车型。2012年斯柯达汽车全球交付量为939,200辆，与2011年相比，交付量增加了6.8%。2012年，斯柯达汽车在中国的年度销量已达到235,700辆，同比增长7.1%，中国市场销量已占全球销量的四分之一。截止到2012年底，斯柯达汽车在全国范围内建立起了390家营销服务网点。斯柯达汽车计划将其2018年全球销售量至少增加到150万辆。
2013年6月20日，斯柯达汽车品牌初步完成了由明锐、晶锐、速派组成的在华产品架构，覆盖了中国车市A0、A、B级市场。
2017年，斯柯达开启了SUV战略，随后于2017年上海车展推出了旗下首款中型SUV柯迪亚克，2017年广州车展推出了紧凑型SUV柯珞克，2018年4月于捷克驻华大使馆斯柯达全新都市SUV柯米克全球首发亮相，2018年广州车展轿跑SUV柯迪亚克GT正式上市。四款SUV的家族阵容也使中国成为斯柯达提供SUV车型数量最多的单一市场。
2021年10月31日，斯柯达发言人卡米拉·比德尔表示，“斯柯达汽车捷克工厂的大部分生产线将在中断两周后，于10月31日晚10:00开始正式恢复生产。”
2022年8月31日，斯柯达官方发布了VISION 7S概念车并公布了新品牌标识 。
全新品牌图标将强化斯柯达在数字化传播渠道的形象，斯柯达文字标识将比品牌图标应用更加广泛。最具挑战性的设计元素是保留“S”上方的“ˇ” 符号，这个符号现在融入到文字标识中的第一个字母。在品牌色彩方面，将使用两种不同的绿色色调——翡翠绿与电光绿 。
2022年10月，斯柯达发布全新纯电动车型——ENYAQ RS iV，进一步扩大斯柯达运动车型系列RS家族。
2022年11月，斯柯达自2008年以来在欧洲发布的所有15款车型在欧盟新车安全评鉴协会及全球汽车碰撞安全测试中都斩获了最高的五星安全评级。